北方战事连战连捷的同时，明军在接受固始汗称臣请求之后，开始派兵在西藏和新疆、青海一带驻军，设置地方机构进行管理。
当然，这样的做法，必然会引发沙皇阿列克谢和叶尔羌汗国的不满。
崇祯二十三年十月，大明与俄罗斯全线开战。这一战线，西起后世新疆一带，东至努尔干地区。
明军联合喀尔喀蒙古、厄鲁特蒙古、和硕特蒙古与叶尔羌和沙俄进行地毯式打击。
十一月底，马进忠率部在贵州战役中击溃叶尔羌，俘获阿不杜热依木之子阿不杜拉，将西套地区收入大明地图。
一个月之后，叶尔羌汗国的统治者阿不杜拉在京师被崇祯皇帝下令处斩。
阿不杜拉死后，其子尧勒瓦斯继承汗位，但仅一月之后就被阿不杜拉之弟苏里所杀。
此后，刚刚统一不久的叶尔羌陷入混乱状态，固始汗迅速出兵，在吐鲁番郊区击溃了苏里的军队。
固始汗的军队进占吐鲁番之后，将城市的拥有权和平交给了随后赶到的马进忠。
这场和俄罗斯、叶尔羌的战争，战线虽然拉的挺老长，但总结来说，对大明完全没有任何影响。
每一路的明军人数都高于俄军，而且明军出动的都是久经善战的边军，火器普及程度甚至超过了落后的俄军。
每一场战斗，几乎都是俄军被打的抱头鼠窜，无数个看似是要塞的城堡，都被明军的十二磅佛朗机重炮轰开了城门。
战争进行到崇祯二十四年的五月时，叶尔羌汗国的全部领土都已经被明军占领。
大明的版图也因此向北扩张了很大一部分，看似是强权的俄军在面对明军时，都成了毫无抵抗之力的小孩子。
六月初，沙皇阿列克谢的使者仓促之间来到京师，要求双方坐在谈判桌上议和。
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